دولت، تنها متولی صدور مجوز
بر اساس گزارشی که در سایت شورای نگهبان منتشر شده، اطلاق عبارت «عرف متشرعه» نسبت به مواردی که شرعاً حکمی به عنوان اولی و ثانوی ندارد، خلاف موازین شرع شناخته شده است.
عبارت «اقدام عملی» و عبارت «معاضدت قضایی» ابهام دارد. پرداخت دیه آمران و ناهیان مغایر اصل ۷۵ قانون اساسی است و اطلاق جرائم در مواردی که شاکی خصوصی دارد، مغایر حق بزه دیده خصوصی است. همچنین ترکیب اعضای ستاد و اینکه در این ماده وظایف اجرایی و بعضاً قضایی پیشبینی شده است، و صلاحیت ستاد در صدور مجوز خلاف قانون اساسی تشخیص داده شده است.